Il eut plusieurs enfants, dont les futurs empereurs Go-Fushimi et Hanazono.
Kōmyō était le second fils l'empereur Go-Fushimi de la lignée Jimyōin-tō.
Kōgon était le fils aîné de l'empereur Go-Fushimi de la lignée Jimyōin-tō.
Il laisse ce titre d'empereur retiré à son fils Go-Fushimi en 1313.
Go-Fushimi était le fils aîné de l'empereur Fushimi et appartenait donc à la lignée Jimyo¯in-to¯.
Go-Fushimi est l'auteur d'une célèbre supplique au dieu du sanctuaire de Kamo pour l'aider à gagner le trône pour son fils.
En 1296, grâce au ralliement de la lignée Daikakuji-tō, il devient prince héitier de son cousin l'empereur Go-Fushimi de la lignée Jimyōin-tō.
En 1298, Fushimi abdique en faveur de son fils et débute son règne d'empereur retiré, mais trois ans plus tard, en 1301, la lignée Daikakuji-tō se rallie et force Go-Fushimi à abdiquer, et Fushimi perd donc son titre d'empereur retiré.